台大工學院在製造自動化方面的研究可追溯至民國七十五年，並在民國七十八年成立電腦整合製造研究群，於民國八十五年二月正式成立製造自動化研究中心 （Manufacturing Automation Technology Research Center, MATRC）。製造自動化研究中心曾研製全國第一套教學用的彈性製造系統（FMS）。本中心下設電腦整合製造研究室、機電整合研究室、電腦輔助設計與製造研究室、機器人系統研究室、生產技術研究室及精密加工研究室。設諮議委員會，負責中心研究主題、儀器設備、經費等業務之規劃。工學院院長兼任主任委員，機械系主任為當然委員。置主任一人，秉承諮議委員會之決議，負責中心業務。
當時的研究目標包括：
1. 研發製造自動化相關之高科技並培育製造自動化相關科技人才。
2. 配合國家製造自動化發展政策，以及台灣大學推動學術研究之目標，發展生產製造自動化技術，以因應國內產業界技術升級之需求，及培育所需製造自動化人才。
3. 整合台灣大學在製造自動化方面的研究，走向具有前瞻性及實用性之製造自動化科技方向，並提供政府有關部門擬訂製造業自動化政策的諮詢。
4. 配合台灣大學其它系所，共同針對製造自動化科技對於社會、經濟、文化及工業倫理之影響，做廣泛之研究，以提供政府參考。
為因應工業發展及機械智慧的演進，中心乃於2018年開始決定改組，並以智能機械與工業4.0相關技術做為研究主軸。本中心改名改組於2019年6月15日國立台灣大學107學年度第2學期第2次校務會議通過，新中心架構如下：